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Depuis l'année 2005/6 un nouveau programme de master et d'études doctorales a été mis en place. Il est issu d'une collaboration entre l'Université Joseph Fourier de Grenoble, l'Université Paris-Sud et l'Université de Crète. Le master, organisé conjointement par les trois départements d'informatique, propose une formation de haut niveau couvrant de nombreuses spécialités de pointe en informatique. Il s'appuie sur les domaines d'expertises des chercheurs des établissements partenaires. Le master conjoint, comme son prolongement naturel, la thèse en cotutelle, participent à l'animation et au renforcement de la coopération scientifique entre ces institutions en vue de jouer un rôle plus actif dans la construction de l'espace européen de l'enseignement supérieur et de la recherche, en ayant comme perspective l'élargissement de ce partenariat à d'autres universités européennes.